Богословский колледж реализует программу профессиональной переподготовки «Основы православного богословия», а также программы повышения квалификации по Священному писанию и истории церкви.

Цель программы профессиональной переподготовки «Основы православного богословия» — дать в рамках небольших курсов целостное и разностороннее представление об основных богословских предметах, более подробное изучение которых доступно в рамках бакалавриата СФИ.

Программа предполагает прослушивание лекций и участие в семинарах по основам Священного писания Ветхого и Нового завета, христианской этики, аскетики, литургики, сакраментологии, догматики и экклезиологии, миссиологии, катехетики и гомилетики.

В учебный план входят также исторические предметы и предметы гуманитарного цикла: всемирная история, история церкви, история религий, история русской культуры, русский язык и культура речи, христианская этика, курс формальной логики, основы которой впоследствии помогают изучать философию. Учащиеся получают навыки работы с богословской литературой.

Полученная квалификация позволяет выпускникам принимать участие в миссионерских проектах, помогать в катехизации; преподавать в школах Основы православной культуры, а также христианскую и светскую этику.

Программы повышения квалификации «Библия: Ветхий завет и Новый завет» и «История церкви» предназначены для абитуриентов, которые хотели бы освоить соответствующие тематические блоки богословских и церковно-исторических дисциплин.

Лекции и семинары в колледже ведут преподаватели СФИ и других вузов.